AlphaFold 3, den nye AI-model udviklet af Google DeepMind og Isomorphic Labs, kan forudsige strukturerne af komplekser dannet af forskellige biomolekyler, herunder protein-DNA-, protein-RNA- og protein-ligand-interaktioner.
AlphaFold 3-implementeringen på Interactive HPC – UCloud er optimeret til brug med GPU’er og inkluderer de nødvendige genetiske (sekvens-) databaser for proteiner og RNA til at køre analysen.
Ud over Batch Mode findes der yderligere versioner af app’en – Lab Mode og Visualization Mode – som henholdsvis gør det muligt at bruge softwaren i et JupyterLab-miljø og at visualisere proteinstrukturer opnået med AlphaFold 3.
AlphaFold 3 er implementeret på Interactive HPC – UCloud for at understøtte specifikke typer arbejde, f.eks. præcis strukturforudsigelse og modellering, og er klar til brug for alle brugere af Interactive HPC – UCloud.
Du kan finde flere oplysninger i UCloud dokumentationen.
