Kategorier
Applikation Supercomputing Vejledning Webinarer og vejledninger - video

Webinaroptagelse: ChatUI and CVAT pipelines

In this video we will guide you through two different AI based workflows, involving ChatUI and CVAT apps.

You will learn how to:

  • Use advanced CVAT features including auto-annotation, algorithmic assistance, management and analytics.
  • Use Chat UI as a flexible interface for hosting of various LLM models, and interact via a chat or API environment.
  • Use ChatUI for semantic search in a knowledge base.
  • Use CVAT as a powerful annotation tool, including image classification, object detection, semantic and instance segmentation, and video / 3D annotations.
Kategorier
Interactive HPC Vejledning Webinarer og vejledninger - video

Webinaroptagelse: Transcribing and editing audio transcriptions with Transcriber and Speech Analyzer apps

In this video we will guide you through the complete pipeline of transcribing audio files from speech to text and editing and classifying transcription segments.

In this session, you’ll learn how to:

  • Use Transcriber for transcribing audio/video files. Transcriber is based on Open AI’s Whisper language model. The app can transcribe speech audio to text in various formats and uses the WhisperX package to perform speaker recognition.
  • Navigate the new, simple, drag and drop Transcriber user interface to make it easier for you to use AI to transcribe audio files.
  • Edit and classify the transcriptions with Speech Analyzer. Speech Analyzer is an application built on top of Label Studio, specifically optimized for dialogue analysis. It enables you to label, edit, and annotate transcriptions generated using Transcriber.
  • Perform a comprehensive dialogue analysis on UCloud involving transcribing audio files using Transcriber, followed by transcription analysis with Speech Analyzer.

All workflows will be executed inside a UCloud project environment with access to GPU resources.

Target audience: Researchers across all Departments, particularly Digital Humanities and Social Science, Students, AI interested.

Kategorier
Interactive HPC Supercomputing UCloud Vejledning Webinarer og vejledninger - video Workshop

Webinaroptagelse: Fine-Tuning and Deploying  Large Language Models

In this video we will guide you through the complete pipeline of fine-tuning large language models (LLMs) for specialised tasks such as medical question-answering using NeMo Framework and Triton Inference Server.

  • Prepare and preprocess open-source datasets for fine-tuning.
  • Apply Parameter-Efficient Fine-Tuning (PEFT) using LoRA with NVIDIA NeMo Framework.
  • Deploy optimised LLMs using NVIDIA Triton Inference Server and TensorRT-LLM.
  • Generate a synthetic Q&A dataset using Label Studio connected to a live inference backend.
  • Fine-tune and evaluate your customised LLM for domain-specific applications.

All workflows will be executed inside a UCloud project environment with access to GPU resources.

Target audience: Machine learning practitioners, researchers, and engineers interested in LLM customisation, domain adaptation, or scalable model deployment.

Technical Level: Intermediate to Advanced.

Notebooks: https://github.com/emolinaro/ucloud-workshop-28-05-2025

Kategorier
Applikation Interactive HPC Supercomputing Undervisning Vejledning Webinarer og vejledninger - video

Webinaroptagelse: UCloud courses hands-on

In this video we will go through the process of developing a course on UCloud, using UCloud Courses – a tool for hosting and managing university courses on UCloud. Wnt to know more about this new feature, check out our webinar recording introducing UCloud Courses.

Introduction

00:00 – Outline of the workshop agenda
03:10 – Introduction to the UCloud Courses concept
04:23 – Advantages of using UCloud Courses
05:56 – Outline of the steps involved in developing a UCloud Course
09:54 – Requesting and planning a UCloud Course
10:20 – Example of the planning and structuring of an existing UCloud Course

Developing a UCloud Course step by step

Setting up the environment
15:53 – Preliminary remarks
17:15 – Showing the existing UCloud Course that will be re-developed in the workshop
18:02 – Showing the UCloud-Courses GitHub repository
18:40 – Software requirements and -recommendations
20:22 – Short introduction to Git and GitHub
24:27 – Cloning the repository
25:15 – Creating a working branch
26:12 – What should go in the UCloud-Courses repository and what shouldn’t
27:24 – Installing the required dependencies

Creating a new UCloud Course and modifying the templates
28:00 – Creating a UCloud Course using a prepared script
30:31 – Walk-through of the different auto-generated files/folders in the course folder
33:35 – Short introduction to Docker
38:15 – Modifying the Dockerfile
42:32 – What should go in the UCloud-Courses repository and what shouldn’t
45:28 – Building the Docker image locally using a prepared script
47:54 – Modifying the starting script
01:00:50 – What can, shouldn’t, and mustn’t be changed while the course is running

Building and testing the course locally
01:05:00 – Re-building the Docker image locally using a prepared script
01:05:25 – Running a Docker container locally using a prepared script
01:10:58 – Opening the JupyterLab interface on localhost

Finalising the course app
01:12:48 – Opening a pull request and requesting code review
01:19:44 – Testing the course app on UCloud before it’s deployed

Closing remarks

01:25:44 – Reusing/updating an existing UCloud course
01:28:19 – The financial model in brief
01:29:38 – Useful links and resources

UCloud-Courses GitHub repository:
https://github.com/SDU-eScience/UCloud-Courses

README in the UCloud-Courses GitHub repository:
https://github.com/SDU-eScience/UCloud-Courses/blob/main/README.md

Wiki page in the UCloud-Courses GitHub repository:
https://github.com/SDU-eScience/UCloud-Courses/wiki

The UCloud course app redeveloped in the workshop (UCloud login required):
https://cloud.sdu.dk/app/jobs/create?app=nlp-demo-course_147222U005

eScience Servicedesk (point of first contact):
https://support.escience.sdu.dk/

Kategorier
Applikation Interactive HPC

Ny app: AlphaFold 3 – et banebrydende værktøj til forudsigelse af proteinstruktur

AlphaFold 3, den nye AI-model udviklet af Google DeepMind og Isomorphic Labs, kan forudsige strukturerne af komplekser dannet af forskellige biomolekyler, herunder protein-DNA-, protein-RNA- og protein-ligand-interaktioner.

AlphaFold 3-implementeringen på Interactive HPC – UCloud er optimeret til brug med GPU’er og inkluderer de nødvendige genetiske (sekvens-) databaser for proteiner og RNA til at køre analysen.

Ud over Batch Mode findes der yderligere versioner af app’en – Lab Mode og Visualization Mode – som henholdsvis gør det muligt at bruge softwaren i et JupyterLab-miljø og at visualisere proteinstrukturer opnået med AlphaFold 3.

AlphaFold 3 er implementeret på Interactive HPC – UCloud for at understøtte specifikke typer arbejde, f.eks. præcis strukturforudsigelse og modellering, og er klar til brug for alle brugere af Interactive HPC – UCloud.

Du kan finde flere oplysninger i UCloud dokumentationen.

Kategorier
Interactive HPC Kald Supercomputing

Færre ressourcer i kommende nationalt HPC-kald

Posten som bestyrelsesforperson for DeiC er aktuelt ubesat, og det medfører forsinkelser i beslutningsprocesser og påvirker kommende HPC kald.

John Renner Hansen, er fratrådt som forperson for DeiCs bestyrelse.  Dette medfører bl.a., at DeiCs bestyrelse for nuværende ikke kan ikke kan tage beslutninger af økonomisk karakter, hvilket påvirker en række igangværende og kommende HPC-aktiviteter.

Det forventes, at Danske Universiteters Rektorkollegium udpeger en ny forperson i begyndelsen af august 2025.

Færre ressourcer i kommende HPC-kald

Næste kald for national HPC-regnetid åbner den 15. juli 2025 og dækker regnetidsperioden 1. januar til 31. december 2026. 

DeiCs kontrakter med DeiC Interactive HPC udløber 31. december 2025, og arbejdet med nye aftaler er i gang. Men da bestyrelsen for nuværende ikke er beslutningsdygtig, kan det ikke garanteres, at de nye aftaler er på plads, inden kaldet åbner.

Derfor vil det kommende kald som udgangspunkt udelukkende omfatte national regnetid på LUMI.

For yderligere information, kontakt dit lokale Front Office.

Dette er en redigeret version af nyheden udgivet af DeiC https://deic.dk/da/news/2025-6-20/forsinkede-kvantekald-og

Kategorier
Applikation Supercomputing UCloud

Ny app: ONLYOFFICE er nu tilgængelig på UCloud

ONLYOFFICE er en browserbaseret office suite til oprettelse og redigering af tekstdokumenter, regneark og præsentationer. Den er fuldt kompatibel med Microsoft Office-formater og har en brugerflade, der gør det nemt at skifte fra traditionelle desktopprogrammer.

ONLYOFFICE er udviklet til dokumentarbejde direkte i UCloud og giver mulighed for at:

  • Oprette og redigere dokumenter gemt i UCloud
  • Arbejde med tekstdokumenter, præsentationer og regneark
  • Uploade og downloade filer uden at forlade platformen
  • Bevare fuld kompatibilitet med Microsoft Office-filtyper

Appen tilbyder kernefunktionalitet via et lettilgængeligt, browserbaseret interface. Der kræves ingen installation af yderligere software.

ONLYOFFICE er tilgængelig for alle UCloud-brugere og er særligt relevant til:

  • Redigering eller forberedelse af akademiske dokumenter
  • Håndtering af strukturerede data i regneark
  • Oprettelse eller gennemgang af præsentationer
  • Samarbejde om tekstarbejde

Yderligere information

For mere information, se UCloud dokumentationen.

Forslag og support

Har du forslag til nye apps eller ønsker til funktionalitet? Kontakt din lokale Front Office.

Kategorier
UCloud Undervisning Vejledning Webinarer og vejledninger - video Workshop

Webinaroptagelse: Introduction to hosting courses on UCloud

I denne video introducerer vi den nye UCloud Courses-app – et værktøj til at hoste og administrere universitetskurser i UCloud.

Dr. Federica Lo Verso guider dig igennem appens koncept og baggrund.
Du får en praktisk demonstration af, hvordan du tilgår og bruger værktøjet, udforsker dets integration med GitHub, og hører direkte fra Dr. Himanshu Khandelia, som deler sine erfaringer med at bruge UCloud Courses i virkelige undervisningssituationer.

Vi guider dig også gennem ansøgningsprocessen, viser dig de tekniske og økonomiske krav og giver dig en forsmag på et kommende praktisk kursus.

Tidskoder:

00:00 – Introduktion ved Dr. Federica Lo Verso
01:23 – Baggrund: Lanceringen af den nye UCloud Courses-app
04:12 – Gennemgang: Hvor du finder Courses-appen, og hvordan du bruger den
07:00 – Opsummering af demonstrationen af UCloud Courses-appen
07:56 – Gennemgang: Sådan fungerer GitHub-repositoriet
10:07 – Fordele ved at bruge Courses på UCloud
11:12 – Introduktion til brugsscenarie: Dr. Himanshu Khandelia
11:58 – Dr. Khandelia deler sine erfaringer med at bruge UCloud Courses
14:00 – Live-demo: Dr. Khandelia viser sin brug af Courses og GitHub-integration
23:00 – Sådan ansøger du: Ansøgningsprocessen for UCloud Courses
24:21 – Påkrævede ressourcer til at køre et UCloud-kursus
25:28 – Sådan genbruger og opdaterer du eksisterende UCloud Courses
26:20 – Økonomisk model: Omkostninger og tilgængelig støtte
27:12 – Outro og teaser til det kommende praktiske kursus

Kategorier
Applikation Supercomputing UCloud

Ny app: Administrer dit næste arrangement med Indico

Indico er en robust open source-platform til eventplanlægning, arkivering og samarbejde – ideel til håndtering af konferencer, workshops og videnskabelige møder.

Nøglefunktioner inkluderer:

  • Eventstyring: Indico gør det muligt at organisere en bred vifte af arrangementer, lige fra små seminarer til store konferencer. Det understøtter hele arrangementets livscyklus, inklusive tilmelding samt indsendelse af abstracts og endelige artikler.Hierarkisk beskyttelse: Indico anvender et hierarkisk beskyttelsessystem, der muliggør forskellige roller og adgangsniveauer inden for arrangementerne.
  • Integration med samarbejdsværktøjer: Indico integrerer problemfrit med værktøjer som Zoom og øger produktiviteten i webbaserede møder.
  • Dokumenthåndtering: Indico gør det nemt at uploade og tilgå præsentationer, artikler og andre dokumenter.

Indico er nu implementeret på UCloud og klar til brug for alle UCloud-brugere.

Du kan finde flere oplysninger i UClouds dokumentation for appen

Kategorier
Supercomputing UCloud Undervisning Vejledning Workshop

Workshop 11/6: UCloud Courses hands-on

Udvikling af din egen UCloud-kursusapp med en nyudviklet skabelonbaseret tilgang

Deltag i en praktisk workshop, hvor vi guider dig gennem alle trin i udviklingen af en UCloud-kursusapp ved hjælp af vores nyudviklede skabelonbaserede tilgang. Konceptet går ud på at have en dedikeret app på UCloud til dit universitetskursus, som studerende kan bruge f.eks. i øvelses-/labsessioner og/eller derhjemme. En introduktion til tilgangen findes i denne webinaroptagelse.

I denne workshop lærer du at:

  • Oversætte din kursusstruktur til en struktur, der er kompatibel med en UCloud-kursusapp.
  • Opsætte kursusudviklingsmiljøet, hvilket indebærer at klone GitHub-repositoriet og køre et kursus-setup-script.
  • Tilpasse de medfølgende skabeloner for at bygge en UCloud-kursusapp, der inkluderer alle nødvendige komponenter – softwareafhængigheder, scripts, datasæt og mere.
  • Teste kurset på din egen computer under udviklingen for at sikre, at alt fungerer korrekt. Vi ser også, hvordan den færdige kursusapp ser ud, når den er lagt på UCloud.

Git/GitHub og Docker er essentielle værktøjer i udviklingen af UCloud-kursusapps. I workshoppen giver vi korte introduktioner til begge værktøjer, primært rettet mod deltagere uden forudgående erfaring. Deltagerne kan med fordel gennemgå introduktionsmateriale til Git og Docker på forhånd, men det er ikke et krav.

Dato: 11. juni 2025

Tidspunkt: 12:30–14:30 (CET)

Sted: Online, via Zoom (link følger)

Målgruppe: Forskere og undervisere fra alle afdelinger på alle danske universiteter

Teknisk niveau: Grundlæggende til avanceret

Tilmeld dig denne workshop