Kategorier
Applikation Supercomputing Vejledning Webinarer og vejledninger - video

Webinaroptagelse: ChatUI and CVAT pipelines

In this video we will guide you through two different AI based workflows, involving ChatUI and CVAT apps.

You will learn how to:

  • Use advanced CVAT features including auto-annotation, algorithmic assistance, management and analytics.
  • Use Chat UI as a flexible interface for hosting of various LLM models, and interact via a chat or API environment.
  • Use ChatUI for semantic search in a knowledge base.
  • Use CVAT as a powerful annotation tool, including image classification, object detection, semantic and instance segmentation, and video / 3D annotations.
Kategorier
Applikation Interactive HPC Supercomputing Undervisning Vejledning Webinarer og vejledninger - video

Webinaroptagelse: UCloud courses hands-on

In this video we will go through the process of developing a course on UCloud, using UCloud Courses – a tool for hosting and managing university courses on UCloud. Wnt to know more about this new feature, check out our webinar recording introducing UCloud Courses.

Introduction

00:00 – Outline of the workshop agenda
03:10 – Introduction to the UCloud Courses concept
04:23 – Advantages of using UCloud Courses
05:56 – Outline of the steps involved in developing a UCloud Course
09:54 – Requesting and planning a UCloud Course
10:20 – Example of the planning and structuring of an existing UCloud Course

Developing a UCloud Course step by step

Setting up the environment
15:53 – Preliminary remarks
17:15 – Showing the existing UCloud Course that will be re-developed in the workshop
18:02 – Showing the UCloud-Courses GitHub repository
18:40 – Software requirements and -recommendations
20:22 – Short introduction to Git and GitHub
24:27 – Cloning the repository
25:15 – Creating a working branch
26:12 – What should go in the UCloud-Courses repository and what shouldn’t
27:24 – Installing the required dependencies

Creating a new UCloud Course and modifying the templates
28:00 – Creating a UCloud Course using a prepared script
30:31 – Walk-through of the different auto-generated files/folders in the course folder
33:35 – Short introduction to Docker
38:15 – Modifying the Dockerfile
42:32 – What should go in the UCloud-Courses repository and what shouldn’t
45:28 – Building the Docker image locally using a prepared script
47:54 – Modifying the starting script
01:00:50 – What can, shouldn’t, and mustn’t be changed while the course is running

Building and testing the course locally
01:05:00 – Re-building the Docker image locally using a prepared script
01:05:25 – Running a Docker container locally using a prepared script
01:10:58 – Opening the JupyterLab interface on localhost

Finalising the course app
01:12:48 – Opening a pull request and requesting code review
01:19:44 – Testing the course app on UCloud before it’s deployed

Closing remarks

01:25:44 – Reusing/updating an existing UCloud course
01:28:19 – The financial model in brief
01:29:38 – Useful links and resources

UCloud-Courses GitHub repository:
https://github.com/SDU-eScience/UCloud-Courses

README in the UCloud-Courses GitHub repository:
https://github.com/SDU-eScience/UCloud-Courses/blob/main/README.md

Wiki page in the UCloud-Courses GitHub repository:
https://github.com/SDU-eScience/UCloud-Courses/wiki

The UCloud course app redeveloped in the workshop (UCloud login required):
https://cloud.sdu.dk/app/jobs/create?app=nlp-demo-course_147222U005

eScience Servicedesk (point of first contact):
https://support.escience.sdu.dk/

Kategorier
Applikation Interactive HPC

Ny app: AlphaFold 3 – et banebrydende værktøj til forudsigelse af proteinstruktur

AlphaFold 3, den nye AI-model udviklet af Google DeepMind og Isomorphic Labs, kan forudsige strukturerne af komplekser dannet af forskellige biomolekyler, herunder protein-DNA-, protein-RNA- og protein-ligand-interaktioner.

AlphaFold 3-implementeringen på Interactive HPC – UCloud er optimeret til brug med GPU’er og inkluderer de nødvendige genetiske (sekvens-) databaser for proteiner og RNA til at køre analysen.

Ud over Batch Mode findes der yderligere versioner af app’en – Lab Mode og Visualization Mode – som henholdsvis gør det muligt at bruge softwaren i et JupyterLab-miljø og at visualisere proteinstrukturer opnået med AlphaFold 3.

AlphaFold 3 er implementeret på Interactive HPC – UCloud for at understøtte specifikke typer arbejde, f.eks. præcis strukturforudsigelse og modellering, og er klar til brug for alle brugere af Interactive HPC – UCloud.

Du kan finde flere oplysninger i UCloud dokumentationen.

Kategorier
Applikation Supercomputing UCloud

Ny app: ONLYOFFICE er nu tilgængelig på UCloud

ONLYOFFICE er en browserbaseret office suite til oprettelse og redigering af tekstdokumenter, regneark og præsentationer. Den er fuldt kompatibel med Microsoft Office-formater og har en brugerflade, der gør det nemt at skifte fra traditionelle desktopprogrammer.

ONLYOFFICE er udviklet til dokumentarbejde direkte i UCloud og giver mulighed for at:

  • Oprette og redigere dokumenter gemt i UCloud
  • Arbejde med tekstdokumenter, præsentationer og regneark
  • Uploade og downloade filer uden at forlade platformen
  • Bevare fuld kompatibilitet med Microsoft Office-filtyper

Appen tilbyder kernefunktionalitet via et lettilgængeligt, browserbaseret interface. Der kræves ingen installation af yderligere software.

ONLYOFFICE er tilgængelig for alle UCloud-brugere og er særligt relevant til:

  • Redigering eller forberedelse af akademiske dokumenter
  • Håndtering af strukturerede data i regneark
  • Oprettelse eller gennemgang af præsentationer
  • Samarbejde om tekstarbejde

Yderligere information

For mere information, se UCloud dokumentationen.

Forslag og support

Har du forslag til nye apps eller ønsker til funktionalitet? Kontakt din lokale Front Office.

Kategorier
Applikation Supercomputing UCloud

Ny app: Administrer dit næste arrangement med Indico

Indico er en robust open source-platform til eventplanlægning, arkivering og samarbejde – ideel til håndtering af konferencer, workshops og videnskabelige møder.

Nøglefunktioner inkluderer:

  • Eventstyring: Indico gør det muligt at organisere en bred vifte af arrangementer, lige fra små seminarer til store konferencer. Det understøtter hele arrangementets livscyklus, inklusive tilmelding samt indsendelse af abstracts og endelige artikler.Hierarkisk beskyttelse: Indico anvender et hierarkisk beskyttelsessystem, der muliggør forskellige roller og adgangsniveauer inden for arrangementerne.
  • Integration med samarbejdsværktøjer: Indico integrerer problemfrit med værktøjer som Zoom og øger produktiviteten i webbaserede møder.
  • Dokumenthåndtering: Indico gør det nemt at uploade og tilgå præsentationer, artikler og andre dokumenter.

Indico er nu implementeret på UCloud og klar til brug for alle UCloud-brugere.

Du kan finde flere oplysninger i UClouds dokumentation for appen

Kategorier
Applikation Interactive HPC Supercomputing

Ny app: Apache Kafka 

Brugere af DeiC Interactive HPC – UCloud kan nu få adgang til Apache Kafka, en højtydende event-streaming platform designet til at håndtere realtidsdata i stor skala.

Kafka-implementeringer på UCloud understøtter multi-node konfigurationer, hvilket muliggør produktionsklar distribueret logging, stream-behandling, dataintegration og publish/subscribe messaging systemer.

Studerende og forskere kan bruge Apache Kafka til at indsamle, behandle og analysere store mængder realtidsdata – for eksempel streamingdata fra laboratoriets sensorer, sociale medier eller webklikstrømme. Det er især nyttigt til at bygge datapipelines i projekter, der involverer maskinlæring, IoT eller realtidsanalyse, og muliggør reproducerbare og skalerbare forskningsarbejdsgange.

For flere detaljer om Apache Kafka-applikationen, besøg UCloud docs for den fulde dokumentation. 

Kategorier
Applikation Supercomputing UCloud

Ny app: Speech Analyzer – Et nyt AI-værktøj til dialoganalyse

Med den voksende efterspørgsel på transskriptions-/AI-tjenester på DeiC Interactive HPC – UCloud, er Speech Analyzer blevet tilføjet til platformen.

Speech Analyzer er en specialiseret applikation, der er bygget oven på Label Studio og optimeret til dialoganalyse. Den gør det muligt for brugerne at mærke, redigere og annotere taletransskriptioner, som er genereret af den integrerede Transcriber-engine. Derudover kan man dele opgaver med samarbejdspartnere.

Tilmeld dig den gratis online workshop om transskribering og redigering af lydtransskriptioner med Transcriber- og Speech Analyzer-apps, der finder sted den 22. maj.

For flere detaljer om Speech Analyzer-applikationen, kan du finde den fulde dokumentation via UCloud Docs.